研究报告

不结球白菜富含甘氨酸 RNA 结合蛋白基因(BcGRP1)的克隆与分析  

汪影 , 张昌伟 , 侯喜林*
南京农业大学, 作物遗传与种质创新国家重点实验室, 农业部华东地区园艺作物生物学与种质创新重点实验室, 南京, 210095
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2018年04月02日    接受日期: 2018年04月26日    发表日期: 2019年01月19日
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摘要

本研究通过分子生物技术从不结球白菜(Brassica campestris ssp. chinensis)中克隆了 BcGRP1,引物根据已报导的拟南芥(Arabidopsis thaliana)和大白菜(Brassica campestris ssp. pekinensis)中的同源基因序列设计。生物信息学方法分析显示 BcGRP1 基因编码 168 个氨基酸,其分子式为 C1414H2323N507O612S94,分子量39 231.67 Da,等电点 5.23;无跨膜结构和信号肽。BcGRP1 蛋白质的 N 端第 9~82 个氨基酸之间包含有一个保守的 RNA 识别基序(RNA recognition motif, RRM)RRM 结构域中包含两段保守的核糖核蛋白结构,被命名为 RNP1 RNP2,它们是 RRM 的活性位点。BcGRP1 基因与与拟南芥以及大白菜中同源基因所编码的氨基酸的相似性在 90%以上。以不结球白菜‘49 菜心’为材料,通过荧光定量 PCR 分析不结球白菜中BcGRP1 在不同处理过程中的表达量变化,本研究结果表明 BcGRP1 基因的表达量在 TuMV 以及 NaCl 处理下的变化不大,该基因对霜霉病以及高温的响应较明显,在这两种处理下,BcGRP1 基因都被明显上调,因此,推测 BcGRP1 基因在这两种胁迫处理下能够起到调控作用。

关键词
不结球白菜;富含甘氨酸 RNA结合蛋白;荧光定量 PCR;基因结构分析

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《分子植物育种》印刷版
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